Afin de structurer les remontées d’informations des établissements vers les décideurs, donner à ces derniers toutes les informations nécessaires et leur permettre de piloter le projet, 3 comités ont été mis en place :

- Des comités des administrateurs formés d’un représentant de chacun des établissements, se réunissent deux fois l’an par bassin, en groupes d’une vingtaine de personnes favorisant l’échange. Avec le prestataire et la mission TICE, ils apportent le point de vue des établissements et en expriment les besoins.
- Un comité de pilotage académique réunit, sous la présidence du recteur, les décideurs académiques et territoriaux pour prendre les décisions stratégiques et politiques.
- Un comité de projet, composé des représentants du prestataire et de la mission TICE, suit l’exécution du marché et traite des problèmes opérationnels. 

Par ailleurs, au sein de chaque établissement, un comité de pilotage ENTEA local réunissant les différentes composantes de la communauté éducative (direction, vie scolaire, enseignants, parents) suit le projet et prend les décisions nécessaires, par exemple le choix des modules qui vont être prioritairement mis en œuvre ou encore l’ouverture de l’ENT aux différents acteurs de la communauté éducative.

Le projet s’appuie également sur le travail de commissions et de groupes de travail.